Description du projet
- Titre du projet : OncoAI – a machine-learning framework to predict cancer cell vulnerability at the gene-regulatory level
- Année de sélection : 2020
- Institution : KULeuven
- Montant octroyé : 578 000 €
- Durée du financement : 4 ans
L’innovation technologique est un élément moteur de la recherche en cancérologie. En particulier, pour l’analyse génétique des tumeurs, ce domaine de recherche s’est radicalement transformé grâce à l’utilisation du séquençage de l’ADN qui génère d’énormes quantités de données. La recherche en cancérologie est en train de devenir une recherche de type « Big Data ». Mais il existe une autre technologie révolutionnaire qui est accueillie avec enthousiasme en recherche : la génomique unicellulaire. Dans notre laboratoire, grâce aux robots et à la « microfluidique » (science de la manipulation de fluides à l’échelle micrométrique), nous pouvons déterminer le transcriptome complet (tous les gènes actifs) et l’épigénome complet (tous les interrupteurs de contrôle) au niveau d’une seule cellule, et ce pour des dizaines de milliers de cellules simultanément. Cela met à portée de main l’énorme défi d’identifier et de caractériser les cellules cancéreuses résistantes aux traitements. Dans ce projet, nous développons de nouvelles techniques d’intelligence artificielle pour comparer des dizaines de milliers de cellules cancéreuses, pour découvrir de nouveaux « états cellulaires » et pour déterminer les interrupteurs moléculaires de ces différents états cellulaires. Nos méthodes et logiciels peuvent être utilisés dans le monde entier pour identifier de tels liens et développer ensuite de nouvelles stratégies diagnostiques et thérapeutiques.
